工程中心积极贯彻落实习总书记对科技工作者的“四个面向”的指示要求，坚持面向世界科技前沿、面向经济主战场、面向国家重大需求、面向人民生命健康，聚焦我国长江上游、三峡库区特色产业，立足重庆、面向西南地区、辐射全国。以动植物与微生物的活性物质为研究对象，建立西南地区特色种质资源库，借助生物技术手段，突破规模化种养、工程化生产的产业瓶颈，研发与创新活性物质工程化生产、产品创制与产业应用的新策略、新理念、新技术，服务我国农业绿色发展、农民致富和国家乡村振兴战略。