工程中心现有用于研究开发的基本仪器和设备价值超过30万有34台/套，它们在工程中心的研究工作和技术开发中发挥了重要作用。在这些仪器设备中，有制备、分离、发酵、纯化生物大分子方面的，如发酵罐、高速冷冻离心机、HPLC等占了相当大的比重。较大型的仪器设备有：X-射线单晶衍射仪、X-射线粉末衍射仪、气质联用仪、核磁共振仪、红外光谱仪、高效液相色谱仪、冷冻干燥仪、蛋白质纯化仪、细胞培养室、超声波破碎仪、倒置荧光显微镜、紫外可见分光光度计、自动液相色谱分离层析仪、双向电泳系统、真空离心浓缩仪、冰冻切片机、超低温冰箱、酶标仪、PCR仪等。